超聲波細胞破碎機在液體里發生空化氣泡的形成，長大和崩滅時產生一個覆蓋著的強壓力脈沖，產生許多獨特的性質，這就是超聲波化學反應中起到關鍵作用的是聲波的空化效應，在超聲波的輻照過程中，在液體里將發生空化氣泡的形成。
細胞粉碎機在超聲空化和強烈攪拌下，將一種固體藥物分數在含有活性劑的水溶液中，經超聲分散后就可以得到更小粒子供靜脈注射。利用這些能量在一些特殊的粉末表面合成奈納米粒子，經過加速使溶劑穿透組織作用，提供中草藥有效成分提取率，如金雞納樹皮中全部生物堿用一般方法浸出需5小時以上，采用超聲分散3到15分鐘即可完成。
在強烈的超聲空化和攪拌下，將一種固體要去分散在含有表面活性劑的水溶液中，將細胞或病菌借助于超聲分散將其殺死后，再用適當的方法制成疫苗，為了更進一步提取藥物精華和粒子微細化，并節約生產成本。
與一般超聲波細胞破碎機相比，它的功率時非常大的，當超聲波在液體中傳播時，由于液體微粒的劇烈振動，會在液體內部產生小空洞，這些小空洞迅速脹大和閉合，會使設備與微粒之間發生猛烈的撞擊作用，從而產生幾千到上萬個大氣壓的壓強。
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