大腸桿菌表達外源蛋白，在超聲破碎的時候用超聲波破碎儀便能起到很好的效果，對其他的一些細菌同樣起作用，比如鏈霉菌，下面來詳細的了解一下吧。
細菌沉淀直接加樣品進行混勻、離心、煮沸后直接上樣，染色脫色步驟如下：將膠放入適量的染色液微波爐里加熱，將染色液換成大量的水在微波爐煮就可以了。在表達重組蛋白后超聲波破碎細胞，采用冰浴 ，但是不一會就會產生大量泡沫，影響了破碎功率。
在實驗過程中若產生氣泡是因為探頭位置沒有放好，探頭一定要接近底部，約1cm。功率根據儀器不同也會有所不同，因此可以觀察液面，注意有波動但不要太劇烈機好。變幅桿位置擺放也要注意，聽聲音如果不對的話就要及時調整，另外可以從菌濃度方面考慮。在破碎時試著加大體積，強度不要超過60%。
嘗試超8秒，對有些菌體蛋白來說，很難散熱，導致蛋白變性產生氣泡，因此停留的時間要稍長一點，這種情況多見于包涵體形式的蛋白。
使用超聲波破碎儀在做大腸柑橘超聲時，采用400W，超5停5的方法，效果不錯，但是用在鏈霉菌上，似乎沒有什么效果，可能死由于細胞壁組成差異造成的，因為大腸桿菌屬于革蘭氏陰性菌的。
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